Jens Flensborg har siden 1999 beskæftiget sig med offentlig ret i bred forstand, hvor han primært optræder som rådgiver for danske kommuner og andre offentlige myndigheder, som han også repræsenterer i administrative klagesager og civile retssager.
Jens primære interesseområder er miljø-, plan- bygge- og naturbeskyttelseslovgivningen. Jens arbejder også i øvrigt meget med areallovgivning, herunder ikke mindst i forbindelse med ekspropriation, hvor han repræsenterer sine klienter i taksations- og retssager.
Jens afholder løbende kurser og seminarer inden for sine kompetenceområder, herunder på KL’s miljøjurauddannelse.
Jens er medforfatter til bogen Ekspropriation i praksis og Planloven med kommentarer.